123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3985 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
319 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.51 
 
 
304 aa  302  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
311 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.79 
 
 
307 aa  218  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
314 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
311 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 
311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
312 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
308 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  35.74 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
315 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
312 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
300 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
309 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
321 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
317 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
316 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
313 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
309 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
316 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
329 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
317 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
329 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.43 
 
 
324 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
318 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
312 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
332 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
324 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
304 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  29.02 
 
 
332 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
301 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
309 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
326 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 
276 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.53 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  23.69 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  23.69 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  23.69 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.69 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.69 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  23.69 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.96 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.51 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.63 
 
 
322 aa  63.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  22.76 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.09 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.79 
 
 
338 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  23.5 
 
 
370 aa  59.3  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.3 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 
327 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.07 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.54 
 
 
336 aa  49.3  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.42 
 
 
326 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.42 
 
 
326 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.97 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.74 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
89 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.56 
 
 
314 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
339 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.62 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.76 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>