More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3958 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 499 aa  1039    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  42.98 
 
 		 210 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  42.98 
 
 		 210 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  45.05 
 
 		 231 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.93 
 
 		 240 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  29.66 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 220 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  43.27 
 
 		 220 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  29.7 
 
 		 367 aa  89  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.76 
 
 		 607 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.31 
 
 		 220 aa  86.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 220 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 239 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.57 
 
 		 239 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  36.63 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  40.91 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 167 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  27.94 
 
 		 1793 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.6 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 217 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.66 
 
 		 217 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  33.59 
 
 		 656 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  41.28 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.68 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.85 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  41.28 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  26.07 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.81 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.17 
 
 		 609 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  36.7 
 
 		 669 aa  80.9  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  28.4 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.33 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  36.28 
 
 		 524 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.54 
 
 		 217 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  38.61 
 
 		 334 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 239 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 227 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  35.92 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  36.09 
 
 		 212 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  37.27 
 
 		 286 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 214 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.41 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  37.27 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  40.19 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.18 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.14 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.61 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 623 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.14 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  27.47 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.45 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.97 
 
 		 209 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  28.51 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  38.74 
 
 		 252 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  41.35 
 
 		 228 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  36.7 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 228 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 228 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.82 
 
 		 241 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>