46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3957 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  100 
 
 
120 aa  240  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  62.71 
 
 
120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  66.04 
 
 
120 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1910  hypothetical protein  51.92 
 
 
124 aa  117  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.724765  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  47.54 
 
 
123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  47.79 
 
 
123 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  50 
 
 
116 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  48.28 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  45.69 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  50.49 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  50.49 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  48.51 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  46.6 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1841  hypothetical protein  44.07 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3402  hypothetical protein  44.07 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  46.6 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  47.06 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  43.75 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  43.75 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  43.75 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  43.75 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  43.75 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  43.75 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  43.75 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  44.35 
 
 
117 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0584  protein of unknown function DUF1304  48.51 
 
 
120 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  45.45 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  47.62 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  47.66 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  38.79 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  44.95 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1871  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.33795  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  37.19 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  36.75 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0949  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.996626  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1666  hypothetical protein  37.96 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1508  hypothetical protein  42.31 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1637  hypothetical protein  34.58 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0253  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  37.74 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1034  hypothetical protein  34.65 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0608505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0455  hypothetical protein  36.84 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0443  hypothetical protein  36.84 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08980  predicted membrane protein  37.72 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.482637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  48.89 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>