123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3953 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3686  transposase IS4 family protein  100 
 
 
412 aa  852    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6486  transposase IS4 family protein  100 
 
 
412 aa  852    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0808322  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5869  transposase IS4 family protein  99.76 
 
 
412 aa  849    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4154  transposase IS4 family protein  99.76 
 
 
412 aa  850    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4150  transposase IS4 family protein  100 
 
 
412 aa  852    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.277384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4418  transposase IS4 family protein  99.76 
 
 
412 aa  849    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000316762  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3953  transposase IS4 family protein  100 
 
 
412 aa  852    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5490  transposase IS4 family protein  99.76 
 
 
412 aa  849    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5316  transposase IS4 family protein  99.76 
 
 
412 aa  848    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_002950  PG0177  ISPg4, transposase  31.47 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0225  ISPg4, transposase  31.47 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0487  ISPg4, transposase  31.47 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0970  ISPg4, transposase  31.47 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.309605 
 
 
-
 
NC_002950  PG1658  ISPg4, transposase  31.47 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.198314 
 
 
-
 
NC_002950  PG0019  ISPg4 transposase  31.47 
 
 
385 aa  189  7e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.808263 
 
 
-
 
NC_002950  PG1673  ISPg4, transposase  31.47 
 
 
385 aa  189  7e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.185706 
 
 
-
 
NC_002950  PG1261  ISPg4, transposase  31.47 
 
 
385 aa  189  8e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0050  ISPg4, transposase  31.2 
 
 
385 aa  187  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2194  ISPg4, transposase  31.2 
 
 
385 aa  187  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  27.76 
 
 
389 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  27.91 
 
 
389 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3567  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1315  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1683  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000475694  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2093  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2386  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000599184  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2507  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3039  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331814  normal  0.984797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3141  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3183  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3447  transposase IS4  27.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1836  transposase, IS4 family protein  28.09 
 
 
389 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2339  transposase, IS4 family protein  28.09 
 
 
389 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0350  transposase IS4 family protein  26.46 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2223  transposase IS4  27.32 
 
 
389 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.285308  normal  0.571436 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0986  putative transposase  28.24 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  25.85 
 
 
389 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  26.63 
 
 
389 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0509  transposase IS4 family protein  28.21 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0772109  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0870  transposase IS4 family protein  28.21 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100589  normal  0.585839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0552  transposase IS4 family protein  27.67 
 
 
381 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0252  ISGsu1, transposase  26.28 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0299  ISGsu1, transposase  26.28 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0957  ISGsu1, transposase  26.28 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2141  ISGsu1, transposase, interruption  26.28 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2180  ISGsu1, transposase  26.28 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2646  transposase IS4 family protein  25.71 
 
 
372 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2900  transposase IS4 family protein  26.8 
 
 
381 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00460334  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2974  transposase IS4 family protein  25.62 
 
 
312 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0015  transposase, IS4 family protein  28.84 
 
 
252 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3996  transposase IS4 family protein  27.35 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4657  transposase IS4 family protein  27.35 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2344  transposase IS4 family protein  25.51 
 
 
261 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.718047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1140  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000344199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2289  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000925206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2744  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000679967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3568  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1952  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3407  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0291  transposase, IS4 family protein  22.04 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2749  transposase, IS4 family protein  22.04 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2754  transposase, IS4 family protein  22.04 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0862  transposase, IS4 family protein  22.04 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0872  transposase, IS4 family protein  22.28 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0884  transposase, IS4 family protein  22.28 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1795  transposase, IS4 family protein  22.28 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0980  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000144163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0261  transposase IS4  24 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3153  transposase IS4  24 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0912286  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4101  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3616  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1554  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1673  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0450  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0242  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0319138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2970  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3633  transposase IS4 family protein  22.65 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0117  transposase IS4 family protein  24.84 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3426  transposase IS4 family protein  24.84 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2487  ISGsu1, transposase  32.26 
 
 
179 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3382  transposase IS4 family protein  22.17 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3846  transposase IS4 family protein  22.17 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4497  transposase IS4 family protein  22.61 
 
 
339 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1770  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0715373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1828  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2500  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2618  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2717  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3356  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0081  transposase IS4 family protein  22.02 
 
 
424 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.985684  normal  0.077965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0637  transposase IS4 family protein  22.66 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0165  hypothetical protein  29.08 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0139  transposase, IS4 family protein  19.87 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0245  transposase, IS4 family protein  19.87 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0443  transposase, IS4 family protein  19.87 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1491  transposase, IS4 family protein  19.87 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1777  transposase, IS4 family protein  19.87 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.395262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2404  transposase, IS4 family protein  19.87 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2461  transposase, IS4 family protein  19.87 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2563  transposase, IS4 family protein  19.87 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000574732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>