34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3949 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  100 
 
 		 327 aa  684    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  39.24 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  36.16 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  35.4 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  31.29 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  29.81 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  33.12 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 338 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  29.52 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  28.31 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  28.43 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.92 
 
 		 769 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  26.02 
 
 		 751 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  24.14 
 
 		 745 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.45 
 
 		 755 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.23 
 
 		 751 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23.6 
 
 		 750 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.8 
 
 		 756 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  21.24 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  24.37 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  24.85 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  22.85 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  22.7 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2620  hypothetical protein  24.82 
 
 		 448 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0236435  hitchhiker  0.00226971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  23.02 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2201  putative terpene cyclase  26.19 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000144579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1580  putative terpene cyclase  26.54 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000363115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0041  putative lyase  26.54 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000993648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  23.82 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  21.62 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  27.78 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4335  hypothetical protein  21.61 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>