43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3939 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  100 
 
 		 649 aa  1313    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  41.51 
 
 		 588 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  34.48 
 
 		 595 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  32.53 
 
 		 587 aa  333  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  30.92 
 
 		 619 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  28.97 
 
 		 605 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.99 
 
 		 735 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  33.33 
 
 		 575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  23.92 
 
 		 572 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  32.37 
 
 		 386 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  24.58 
 
 		 382 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.3 
 
 		 708 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  26.09 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 875 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.71 
 
 		 704 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.15 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1106 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0478  hypothetical protein  33.52 
 
 		 262 aa  53.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.438425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1153 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1176 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 1094 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1102 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 1097 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1119 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1090 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1165 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 923 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5533  hypothetical protein  22.41 
 
 		 996 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 883 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1139 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 1138 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 1103 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 1146 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0074  hypothetical protein  37.65 
 
 		 165 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000360926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1160 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  30.3 
 
 		 1211 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3337  TonB-dependent receptor, plug  22.44 
 
 		 1119 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.661419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1144 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1092 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  20.89 
 
 		 1128 aa  44.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1114 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1186 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1089 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>