75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3928 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 100 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  86.6 
 
 		 99 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  85.57 
 
 		 99 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  82.47 
 
 		 99 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  80.61 
 
 		 100 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  81.44 
 
 		 96 aa  144  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  76.29 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  70.1 
 
 		 98 aa  132  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  70.71 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  71.13 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  75 
 
 		 84 aa  120  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  70.1 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  62.63 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  59 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  62.89 
 
 		 96 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  57.58 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  55 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  53.01 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  56.96 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  50.96 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  51.02 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  51.02 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  62.16 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  56.96 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  45.36 
 
 		 540 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  41.41 
 
 		 481 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  44 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  40.48 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 		 466 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  47.31 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  54.17 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  40.59 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  44.9 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  39.39 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  42 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  39.39 
 
 		 469 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  40.28 
 
 		 1379 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  36.96 
 
 		 379 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  42.42 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  37.37 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  43.88 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  42.03 
 
 		 855 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  37.96 
 
 		 592 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  35.87 
 
 		 386 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  41.79 
 
 		 1229 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  42.86 
 
 		 1556 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  42.68 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  46.58 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  45 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  45 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  40.4 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 406 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  35.9 
 
 		 1475 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  35 
 
 		 1422 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  35.9 
 
 		 1457 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  37.93 
 
 		 1437 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  34.48 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  40.79 
 
 		 1386 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  35.53 
 
 		 1423 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 85 aa  42  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  34.48 
 
 		 1446 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  47.62 
 
 		 1600 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  36.71 
 
 		 386 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  36.78 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  47.62 
 
 		 1505 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  47.62 
 
 		 1616 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  35.53 
 
 		 1421 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  38.81 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1527 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  63.33 
 
 		 1388 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0925  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 		 94 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  41.86 
 
 		 94 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  34.78 
 
 		 1381 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>