128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3748 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  1000    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  55.53 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  54.53 
 
 		 482 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  47.55 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  49.28 
 
 		 481 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  40.24 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  38.22 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  25.49 
 
 		 451 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 482 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  26.26 
 
 		 452 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 486 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  25.54 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  25.1 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  29.48 
 
 		 459 aa  87.4  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  23.87 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  29.39 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  29.17 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  26.4 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  23.27 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  24.14 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  28.51 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  22.97 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  22.61 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  25.44 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  21.9 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  37.07 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  25.55 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  22.39 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  28.24 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  22.43 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  23.66 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  23.6 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 664 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  22.51 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  34.35 
 
 		 493 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  22.33 
 
 		 530 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  24.8 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  33.58 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  23.75 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 613 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 556 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 456 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 574 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  23 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 564 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.92 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  21.9 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  22.72 
 
 		 511 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 612 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  22.94 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  29.1 
 
 		 502 aa  52  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 520 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 514 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  30.2 
 
 		 531 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  22.88 
 
 		 481 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  29.38 
 
 		 532 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  22.22 
 
 		 467 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 506 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  21.37 
 
 		 479 aa  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 604 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  24.55 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.07 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 498 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 556 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 510 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>