More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3740 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  49.62 
 
 		 638 aa  661    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  50.46 
 
 		 656 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  100 
 
 		 667 aa  1365    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  50 
 
 		 646 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 632 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  54.58 
 
 		 535 aa  599  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  38.96 
 
 		 641 aa  452  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  37.52 
 
 		 667 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  38.03 
 
 		 668 aa  437  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  36.3 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  41.58 
 
 		 564 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  38.59 
 
 		 651 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 		 663 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  37.37 
 
 		 663 aa  431  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  42.59 
 
 		 575 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  36.54 
 
 		 685 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 767 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.81 
 
 		 709 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  41.94 
 
 		 564 aa  422  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  41.59 
 
 		 581 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  36.92 
 
 		 672 aa  418  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 		 650 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  40.38 
 
 		 630 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 		 645 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  37.56 
 
 		 650 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  40.76 
 
 		 637 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  41.36 
 
 		 569 aa  416  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  37.15 
 
 		 652 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  36.1 
 
 		 649 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 545 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 648 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  37 
 
 		 652 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  41.79 
 
 		 653 aa  411  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  41.44 
 
 		 567 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  36.01 
 
 		 648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  35.03 
 
 		 645 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  35.55 
 
 		 643 aa  409  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.56 
 
 		 690 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  41.12 
 
 		 656 aa  403  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  35.69 
 
 		 641 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  41.09 
 
 		 540 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.93 
 
 		 645 aa  399  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  38.54 
 
 		 642 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  39.55 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 540 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  39.15 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  39.29 
 
 		 540 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  39.29 
 
 		 540 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  39.56 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  33.38 
 
 		 666 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  39.77 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  39.1 
 
 		 540 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 641 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  39.2 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  36.23 
 
 		 644 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  38.6 
 
 		 548 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  39.74 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  38.35 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.73 
 
 		 634 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  38.55 
 
 		 543 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  38.95 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  38.52 
 
 		 545 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  39.47 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  38.87 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  39.47 
 
 		 540 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  38.8 
 
 		 548 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  37.9 
 
 		 544 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  39.96 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  38.3 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  37.21 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 548 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  39.02 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  38.27 
 
 		 664 aa  386  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.85 
 
 		 637 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  38.31 
 
 		 560 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.52 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  38.99 
 
 		 574 aa  385  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  40.11 
 
 		 540 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  35.98 
 
 		 659 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 659 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 		 635 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 		 658 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  34.14 
 
 		 658 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 		 640 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 536 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  38.16 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 635 aa  382  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 		 635 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 545 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  37.36 
 
 		 546 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  33.07 
 
 		 619 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  39.58 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  33.88 
 
 		 648 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 		 635 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 		 659 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  34.14 
 
 		 658 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 		 572 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  40.3 
 
 		 572 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.43 
 
 		 635 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>