248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3720 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  821    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  54.83 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  55.07 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  52.73 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  58.01 
 
 		 569 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  40.16 
 
 		 593 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  45.76 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  38.31 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  36.87 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  38.72 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  40.23 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  40.26 
 
 		 442 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  37.72 
 
 		 582 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  39.55 
 
 		 580 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  37.36 
 
 		 580 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  39.66 
 
 		 579 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  39.55 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  38.59 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  32.62 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  37.09 
 
 		 611 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  37.07 
 
 		 593 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  33.14 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  31.48 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  35.54 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  35.54 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  38.28 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  33.22 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  30.31 
 
 		 473 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  34.94 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  32.02 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  28.73 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  33.11 
 
 		 423 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  34.33 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  30.68 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  30.63 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  25.67 
 
 		 357 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  34.23 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  25.86 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  30.56 
 
 		 492 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  27.49 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  29.82 
 
 		 498 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  29.51 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  29.07 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  27.59 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  28.48 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  30.51 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  30.47 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  25.17 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  27.51 
 
 		 369 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  25.64 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  28.8 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  27.18 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  27.86 
 
 		 331 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  28.87 
 
 		 489 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  31.74 
 
 		 473 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  32.29 
 
 		 483 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  25.33 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  25.95 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  34.64 
 
 		 239 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  24.56 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  28.12 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  23.76 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  24.56 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  28.76 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  28.12 
 
 		 340 aa  89.7  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  25.08 
 
 		 354 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  26.35 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  25.55 
 
 		 369 aa  87  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  27.69 
 
 		 356 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  27.69 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  27.36 
 
 		 356 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  27.69 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  27.87 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  25.17 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  25.75 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  26.34 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  25.7 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  24.73 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  27.04 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  26.14 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  26.62 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  29.31 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  24.36 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  28.64 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  24.76 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  26.2 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  27.41 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2170  hypothetical protein  29.06 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  23.02 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.819809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  27.12 
 
 		 311 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  26.43 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  26.72 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  26.43 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  26.74 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  31.67 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  26.11 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  30.43 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>