299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3668 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  48.28 
 
 
204 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  43.96 
 
 
210 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  46.15 
 
 
202 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  43.15 
 
 
209 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  40.57 
 
 
212 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  46.56 
 
 
210 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  44.39 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  43.63 
 
 
206 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  43.07 
 
 
210 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  44.27 
 
 
212 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  42.23 
 
 
205 aa  159  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 
213 aa  154  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  39.81 
 
 
206 aa  153  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  43.59 
 
 
209 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  44.21 
 
 
212 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  38.65 
 
 
242 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  39.13 
 
 
219 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  43.98 
 
 
213 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  42.16 
 
 
210 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  41.27 
 
 
212 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  41.27 
 
 
212 aa  148  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  40.21 
 
 
202 aa  148  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  39.7 
 
 
232 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  42.16 
 
 
202 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  42.46 
 
 
210 aa  138  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  36.89 
 
 
232 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  43.78 
 
 
213 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  38.95 
 
 
474 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  39.15 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  36.7 
 
 
216 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  37.31 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  36.24 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  36.79 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  40.41 
 
 
216 aa  128  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  38.92 
 
 
206 aa  128  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  35.87 
 
 
221 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  36.6 
 
 
217 aa  111  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  35.2 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  31.88 
 
 
201 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  31.88 
 
 
201 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  34.08 
 
 
239 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  36.59 
 
 
203 aa  104  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  33.8 
 
 
266 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  36.31 
 
 
211 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  34.08 
 
 
239 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  32.37 
 
 
201 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  35.06 
 
 
228 aa  101  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  31.96 
 
 
243 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  33.97 
 
 
238 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.12 
 
 
646 aa  98.2  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  38.46 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  32.54 
 
 
244 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  36.36 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  33.18 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  32.23 
 
 
247 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  34.32 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  31.11 
 
 
249 aa  95.9  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  34.12 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  35.33 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  33.71 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  37.28 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  38.69 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  32.86 
 
 
242 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  34.88 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  31.92 
 
 
263 aa  94.7  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  34.81 
 
 
237 aa  94.7  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  31 
 
 
245 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  31.46 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  31.88 
 
 
244 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  30.77 
 
 
241 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  33.49 
 
 
226 aa  92  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  35.32 
 
 
223 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  33.14 
 
 
217 aa  92  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
243 aa  91.7  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  29.39 
 
 
238 aa  91.7  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  32.06 
 
 
262 aa  91.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  32.06 
 
 
251 aa  91.3  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  32.58 
 
 
217 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  32.16 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  32.71 
 
 
239 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  32.02 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  31.92 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  29.05 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  31.46 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  31.39 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  32.2 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  32.18 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  31.94 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  30.99 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  31.73 
 
 
238 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  35.15 
 
 
221 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  30.51 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  35.63 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  30.95 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  29.13 
 
 
225 aa  89  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  33.18 
 
 
240 aa  89  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  34.48 
 
 
225 aa  89  5e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  29.13 
 
 
225 aa  89  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  31.48 
 
 
240 aa  88.6  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>