More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3599 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  100 
 
 		 406 aa  820    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  39.79 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  33.85 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  35.48 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  33.97 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  31.22 
 
 		 463 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  29.53 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  31.08 
 
 		 485 aa  155  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  32 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  30.07 
 
 		 494 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  29.28 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  27.25 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  27.09 
 
 		 533 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  29.36 
 
 		 538 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  26.49 
 
 		 566 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  26.44 
 
 		 496 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  26.05 
 
 		 522 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  27.93 
 
 		 527 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  28.99 
 
 		 530 aa  97.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  27.58 
 
 		 530 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  26.59 
 
 		 488 aa  89.7  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  28.48 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  25.53 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  24.26 
 
 		 507 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  26.77 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  26.27 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  27.02 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  28.95 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  26.18 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  25.86 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  26.1 
 
 		 434 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  27.08 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  25.32 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  24.55 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  28.08 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 710 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  23.79 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  24.74 
 
 		 551 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  27.54 
 
 		 554 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  23.85 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  23.4 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  26.21 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  23.4 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  25.42 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  26.36 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  24.89 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  24.89 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  27.74 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  27.62 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  24.52 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  24.23 
 
 		 545 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  25.86 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  28.18 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  25.77 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  25.68 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  25.95 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  27.31 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  27.04 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  23.21 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  25.07 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  23.73 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  25.4 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  24.32 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  23.89 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  26.92 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  26.38 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  24.19 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  25.45 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  30.32 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  23.98 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  26.57 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  24.48 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  26.52 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  24 
 
 		 567 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  23.86 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  28.57 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  28.63 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  28.74 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  25.61 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  27.71 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  24.29 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  26.91 
 
 		 564 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  24.32 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  22.04 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  24.32 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  27.54 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  22.78 
 
 		 553 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>