More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3592 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  100 
 
 		 442 aa  888    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  63.07 
 
 		 450 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  45.76 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  42.27 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  40.5 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  39.25 
 
 		 491 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  38.97 
 
 		 491 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  38.97 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  38.97 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  38.97 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  38.97 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  38.97 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  39.86 
 
 		 480 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  38.87 
 
 		 491 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  38.93 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  38.46 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  39.24 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  37.24 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  38.18 
 
 		 468 aa  295  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  38.91 
 
 		 444 aa  293  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  38.7 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  35.22 
 
 		 475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  38.23 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  37.58 
 
 		 468 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  36.15 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  36.78 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  36.24 
 
 		 475 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  35.76 
 
 		 466 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  36.93 
 
 		 486 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  37.34 
 
 		 499 aa  270  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  38.04 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  34.67 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  37.28 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  35.75 
 
 		 464 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  39.68 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  38.58 
 
 		 493 aa  264  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  33.26 
 
 		 477 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  35.87 
 
 		 468 aa  262  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  34.95 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  35.54 
 
 		 507 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  35 
 
 		 463 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  34.66 
 
 		 437 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.77 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  34.9 
 
 		 480 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  36.99 
 
 		 448 aa  256  4e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  36.74 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  37.39 
 
 		 494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  36.29 
 
 		 496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  37.42 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  37.42 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  37.42 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  33.41 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  35.23 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35.02 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  33.92 
 
 		 544 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  34.7 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  36.19 
 
 		 468 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  37.99 
 
 		 490 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  37.15 
 
 		 482 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  34.54 
 
 		 471 aa  250  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  34.48 
 
 		 457 aa  249  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  34.97 
 
 		 476 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  36.28 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  33.96 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  34.12 
 
 		 497 aa  247  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  34.77 
 
 		 487 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  35.64 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  36.18 
 
 		 484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  35.11 
 
 		 474 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  35.35 
 
 		 472 aa  243  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  35.71 
 
 		 443 aa  243  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  34.49 
 
 		 452 aa  242  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  35.67 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.79 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.87 
 
 		 468 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  36.36 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  35.67 
 
 		 473 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  37.69 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  35.06 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  34.09 
 
 		 482 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  32.53 
 
 		 473 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  36.38 
 
 		 430 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  32.65 
 
 		 473 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  34.09 
 
 		 472 aa  232  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  32.24 
 
 		 480 aa  232  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  33.86 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  34 
 
 		 479 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  33.86 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  33.86 
 
 		 472 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  36.87 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.93 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  34.94 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.59 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  33.86 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  33.86 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  33.86 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  32.35 
 
 		 477 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  33.86 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  34.79 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  34.79 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>