More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3545 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
207 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1426  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.52 
 
 
224 aa  184  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.681174  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.28 
 
 
227 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.042412 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 
207 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
207 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
212 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.5 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.3 
 
 
199 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
199 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.5 
 
 
204 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.92 
 
 
202 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.87 
 
 
199 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35.82 
 
 
199 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.93 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.85 
 
 
205 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.5 
 
 
202 aa  116  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.45 
 
 
204 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.51 
 
 
216 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  34.66 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.51 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.27 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.7 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.17 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.54 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.54 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.85 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.57 
 
 
216 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  37.86 
 
 
208 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.34 
 
 
208 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.17 
 
 
213 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.34 
 
 
208 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.66 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.85 
 
 
202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.83 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.05 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.5 
 
 
202 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 
206 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.55 
 
 
214 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.55 
 
 
214 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.08 
 
 
203 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.04 
 
 
201 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.61 
 
 
232 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.12 
 
 
232 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.63 
 
 
193 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.12 
 
 
232 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  35.83 
 
 
202 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.28 
 
 
206 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  38.37 
 
 
202 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33 
 
 
202 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0529615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  33.66 
 
 
202 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.7 
 
 
199 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.84 
 
 
238 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 
198 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  30.91 
 
 
219 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.33 
 
 
198 aa  104  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.8 
 
 
210 aa  104  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.21 
 
 
198 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.96 
 
 
201 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.35 
 
 
206 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.04 
 
 
201 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  35.33 
 
 
201 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.93 
 
 
202 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.96 
 
 
201 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.03 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.48 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 
207 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.03 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.03 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.73 
 
 
236 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.69 
 
 
195 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 
198 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.83 
 
 
216 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.63 
 
 
198 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  34.64 
 
 
206 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  35.59 
 
 
192 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.32 
 
 
198 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.32 
 
 
198 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.23 
 
 
209 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.32 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.32 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.32 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.32 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.32 
 
 
237 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.42 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3715  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.24 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.336776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  33.17 
 
 
203 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.17 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  33.51 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.57 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>