269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3531 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  47.73 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2045  MarR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  33.59 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  38.64 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  35.8 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  35.19 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  37.21 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  38.89 
 
 		 171 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  36.14 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  33.73 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  33.77 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2887  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.11 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  28.89 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  34.62 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  34.29 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.88 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  30.84 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  34.57 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 194 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>