More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3465 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
389 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  53.52 
 
 
391 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 
413 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  39.28 
 
 
394 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  38.23 
 
 
383 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.22 
 
 
399 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.22 
 
 
399 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.22 
 
 
399 aa  234  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  39.5 
 
 
403 aa  232  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
410 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
399 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  42.02 
 
 
402 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  34.92 
 
 
399 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  35.75 
 
 
399 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  34.64 
 
 
399 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  36.62 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
402 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  38.72 
 
 
399 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.61 
 
 
394 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.61 
 
 
394 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.61 
 
 
394 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.61 
 
 
394 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 
406 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 
406 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  34.66 
 
 
385 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  38.97 
 
 
404 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  34.36 
 
 
399 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.44 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.5 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.06 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  38.72 
 
 
394 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  39 
 
 
398 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  39 
 
 
398 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  39 
 
 
429 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  39 
 
 
398 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  39 
 
 
398 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  39 
 
 
398 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  39 
 
 
429 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  38.61 
 
 
394 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  38.72 
 
 
394 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  38.72 
 
 
394 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.33 
 
 
394 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  38.72 
 
 
394 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  33.25 
 
 
411 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  37.5 
 
 
407 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  36.52 
 
 
405 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  39 
 
 
399 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
389 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  34.88 
 
 
405 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  34.88 
 
 
405 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  37.66 
 
 
399 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  37.82 
 
 
399 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  39.28 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  39.28 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  36.32 
 
 
405 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 
413 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
397 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  34.87 
 
 
405 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  34.87 
 
 
405 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  34.87 
 
 
405 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  37.94 
 
 
389 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  37.18 
 
 
415 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  38.66 
 
 
399 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 
399 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  35.15 
 
 
395 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  35.16 
 
 
393 aa  199  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  38.38 
 
 
399 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  36.12 
 
 
398 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  36.57 
 
 
400 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  34.78 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  36.57 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  36.57 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  34.78 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  36.46 
 
 
398 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 
415 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  35.91 
 
 
395 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  36.46 
 
 
403 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 
407 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  35.28 
 
 
399 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  36.36 
 
 
402 aa  190  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  35.28 
 
 
399 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  35.28 
 
 
399 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  35.28 
 
 
405 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  35.28 
 
 
399 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  35.28 
 
 
399 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  35.28 
 
 
399 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  36.02 
 
 
394 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  34.09 
 
 
404 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 
394 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  34.31 
 
 
399 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
408 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  35.22 
 
 
391 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 
396 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  32.73 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>