99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3459 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  524  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  42.51 
 
 
244 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  40.75 
 
 
293 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  39.61 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 
298 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  38.17 
 
 
309 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.7 
 
 
304 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  40.23 
 
 
299 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  38.91 
 
 
258 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  35.55 
 
 
255 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  38.04 
 
 
255 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 
255 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 
255 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  40.32 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  37.4 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  36.15 
 
 
258 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  38.91 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  36.05 
 
 
259 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  25.69 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  23.75 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.78 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  29.35 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  21.96 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  23.27 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  25.98 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  23.74 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  25.22 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  25.25 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  21.03 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  22.35 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  25.4 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  23.47 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  21.26 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  24.03 
 
 
342 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  24.03 
 
 
342 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  24.03 
 
 
329 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 
352 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  24.38 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  25.95 
 
 
377 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  24.41 
 
 
363 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  24.41 
 
 
357 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  19.84 
 
 
295 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  20.42 
 
 
201 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
353 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.26 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  25.42 
 
 
336 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  23.46 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.64 
 
 
362 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1725  beta-lactamase domain protein  23.14 
 
 
235 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12233  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  22.87 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  26.01 
 
 
337 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  24.29 
 
 
375 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  26.32 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.04 
 
 
376 aa  48.5  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  25.6 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  23.32 
 
 
334 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  22.73 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  22.41 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4354  metal-dependent hydrolase  27.01 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  24.35 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  23.75 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  22 
 
 
227 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.32 
 
 
364 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.04 
 
 
264 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  23.44 
 
 
366 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  27.01 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  25.14 
 
 
330 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  27.67 
 
 
233 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 
353 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  27.01 
 
 
227 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  23.44 
 
 
358 aa  45.4  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 
353 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4747  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.44 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  27.32 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.12 
 
 
364 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.41 
 
 
526 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  23.43 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  26.06 
 
 
353 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 
363 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  27.98 
 
 
353 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  25.21 
 
 
281 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  25.98 
 
 
383 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  21.51 
 
 
369 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  24.71 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4741  metal-dependent hydrolase  27.01 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  23.04 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
340 aa  42.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  23.86 
 
 
362 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  24.87 
 
 
356 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>