More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3352 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 
415 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.31 
 
 
404 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.31 
 
 
408 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  56.65 
 
 
414 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  55.96 
 
 
420 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.31 
 
 
418 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.08 
 
 
412 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  54.73 
 
 
404 aa  488  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.64 
 
 
451 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  53.88 
 
 
405 aa  484  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  53.88 
 
 
405 aa  485  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.36 
 
 
406 aa  475  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  52.72 
 
 
419 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  52.14 
 
 
425 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.09 
 
 
425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.76 
 
 
404 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  53.35 
 
 
412 aa  468  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.77 
 
 
404 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.62 
 
 
429 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.13 
 
 
429 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.15 
 
 
419 aa  464  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.87 
 
 
429 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.25 
 
 
421 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.26 
 
 
416 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  53.52 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.76 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.73 
 
 
444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.16 
 
 
621 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
774 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
672 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.62 
 
 
664 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  49.25 
 
 
626 aa  443  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.25 
 
 
416 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 
674 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.01 
 
 
679 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.49 
 
 
673 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.62 
 
 
605 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.5 
 
 
406 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.85 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  51.71 
 
 
417 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.87 
 
 
414 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.28 
 
 
608 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.02 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  47.34 
 
 
604 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  47.78 
 
 
661 aa  438  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.52 
 
 
630 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.25 
 
 
406 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  47.34 
 
 
604 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.25 
 
 
406 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 
417 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.23 
 
 
408 aa  435  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.67 
 
 
629 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.83 
 
 
657 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  50.5 
 
 
413 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50 
 
 
407 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.49 
 
 
427 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  50 
 
 
405 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.64 
 
 
406 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50 
 
 
406 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.37 
 
 
418 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  48.39 
 
 
682 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  48.5 
 
 
688 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50 
 
 
406 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50 
 
 
406 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.4 
 
 
414 aa  428  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.37 
 
 
418 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.27 
 
 
406 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.75 
 
 
426 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.75 
 
 
406 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.26 
 
 
666 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.67 
 
 
413 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
418 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49 
 
 
407 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.62 
 
 
406 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.24 
 
 
678 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.62 
 
 
662 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.99 
 
 
406 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.69 
 
 
414 aa  425  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.27 
 
 
406 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49.75 
 
 
406 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.75 
 
 
650 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 
405 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.61 
 
 
406 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.27 
 
 
406 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.27 
 
 
406 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  48.02 
 
 
406 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  48.02 
 
 
406 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  47.25 
 
 
666 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.27 
 
 
406 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.32 
 
 
420 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.77 
 
 
406 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.02 
 
 
406 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.89 
 
 
412 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.52 
 
 
641 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.83 
 
 
414 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.93 
 
 
413 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.01 
 
 
414 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.16 
 
 
414 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  49 
 
 
420 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.97 
 
 
644 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>