More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3333 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  52.46 
 
 		 757 aa  745    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  54.34 
 
 		 745 aa  775    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  59.6 
 
 		 741 aa  833    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 747 aa  1488    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  55.03 
 
 		 741 aa  800    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  48.05 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  48.54 
 
 		 587 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  48.66 
 
 		 586 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  48.9 
 
 		 586 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  48.66 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  48.66 
 
 		 586 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  45.52 
 
 		 585 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  45.07 
 
 		 585 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  33.29 
 
 		 782 aa  389  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  47.07 
 
 		 587 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  42.68 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  43.93 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  44.72 
 
 		 585 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  41.68 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  44.91 
 
 		 710 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 		 777 aa  286  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 771 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 764 aa  260  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 671 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 673 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  34.21 
 
 		 762 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 		 773 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 		 771 aa  189  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 		 441 aa  188  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 		 652 aa  187  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 		 567 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 		 567 aa  184  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  26.37 
 
 		 650 aa  181  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.37 
 
 		 567 aa  181  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 		 775 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 		 674 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  32.62 
 
 		 606 aa  173  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 		 666 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 665 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 		 665 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 		 665 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 606 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 		 573 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  33.59 
 
 		 624 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 		 667 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 		 662 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.29 
 
 		 671 aa  168  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 666 aa  168  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  32.25 
 
 		 584 aa  167  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  31.71 
 
 		 575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 688 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 741 aa  165  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  32.32 
 
 		 562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 584 aa  163  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 666 aa  160  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 586 aa  160  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 		 664 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 656 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 658 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 		 684 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.52 
 
 		 697 aa  157  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 613 aa  157  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  29.5 
 
 		 563 aa  157  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  31.63 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  30.39 
 
 		 564 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  29.74 
 
 		 682 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  27.41 
 
 		 666 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  30.95 
 
 		 583 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 		 672 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  29.16 
 
 		 566 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  32.14 
 
 		 582 aa  154  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  33.42 
 
 		 566 aa  153  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  33.43 
 
 		 555 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 665 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 		 631 aa  152  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  28.86 
 
 		 561 aa  151  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 674 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  28.64 
 
 		 561 aa  151  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  33.16 
 
 		 569 aa  150  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  30.82 
 
 		 563 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 664 aa  150  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  30.82 
 
 		 563 aa  150  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  30.16 
 
 		 585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 605 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 605 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 		 558 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.33 
 
 		 558 aa  149  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 		 558 aa  149  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 		 558 aa  149  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 		 558 aa  149  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 		 558 aa  149  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 558 aa  149  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 		 558 aa  149  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  33.06 
 
 		 562 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  31.74 
 
 		 576 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 668 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>