More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3320 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  60.59 
 
 
511 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  60.65 
 
 
523 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  64.6 
 
 
522 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  100 
 
 
520 aa  1086    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5375  sulfatase  54.92 
 
 
560 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  51.58 
 
 
511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  48.33 
 
 
545 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  49.12 
 
 
515 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  48.89 
 
 
526 aa  466  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1074  sulfatase  42.13 
 
 
552 aa  411  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0111181 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1033  sulfatase  36.4 
 
 
581 aa  348  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  39.52 
 
 
474 aa  344  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  39.24 
 
 
483 aa  344  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  40.97 
 
 
537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  40.28 
 
 
506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  38.41 
 
 
478 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  34.11 
 
 
549 aa  296  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  32.18 
 
 
537 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  33.33 
 
 
564 aa  266  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  31.96 
 
 
559 aa  253  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  30.89 
 
 
485 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  28.43 
 
 
453 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  28.49 
 
 
474 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  25.51 
 
 
526 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  28.09 
 
 
480 aa  157  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  27.15 
 
 
554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.48 
 
 
499 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  26.25 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  27.6 
 
 
499 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  26.96 
 
 
536 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  26.96 
 
 
536 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  26.36 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  26.16 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  26.16 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  26.16 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  26.16 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  26.16 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  26.16 
 
 
517 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  27.2 
 
 
480 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  26.7 
 
 
553 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  26.15 
 
 
514 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2610  sulfatase  26.74 
 
 
477 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000218719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4926  sulfatase  28.78 
 
 
534 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  25.7 
 
 
517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  25.62 
 
 
541 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  25.49 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  27.48 
 
 
533 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  26.55 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  27.33 
 
 
620 aa  134  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  25.27 
 
 
523 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  27.68 
 
 
523 aa  133  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  26.19 
 
 
508 aa  130  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  25.62 
 
 
536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  25.5 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  24.86 
 
 
519 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  25.31 
 
 
449 aa  128  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  25.93 
 
 
503 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  24.56 
 
 
451 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  25.98 
 
 
491 aa  127  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  27.72 
 
 
542 aa  126  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  23.82 
 
 
497 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  26.53 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2202  sulfatase  25.99 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  24.81 
 
 
514 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  26.71 
 
 
555 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3902  sulfatase  25.05 
 
 
522 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  23.21 
 
 
501 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  25.1 
 
 
498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  24.05 
 
 
563 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  22.78 
 
 
500 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  25.18 
 
 
766 aa  120  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  24.82 
 
 
507 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  24.03 
 
 
496 aa  120  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  25.64 
 
 
478 aa  120  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  25.15 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  24.95 
 
 
519 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  24.71 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  25.2 
 
 
488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  24.1 
 
 
500 aa  118  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3379  sulfatase  24.63 
 
 
517 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0945  sulfatase  24.63 
 
 
517 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0996  sulfatase  24.63 
 
 
517 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.884308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  25.24 
 
 
493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0627  sulfatase  26.52 
 
 
474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  23.58 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  25.31 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  23.78 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  21.33 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  24.12 
 
 
584 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  23.25 
 
 
510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3110  sulfatase  24.7 
 
 
492 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  25 
 
 
440 aa  114  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  26.29 
 
 
501 aa  113  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  22.41 
 
 
486 aa  113  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  30.22 
 
 
535 aa  113  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  24.06 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  25.05 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  24.18 
 
 
497 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2400  sulfatase  24.16 
 
 
589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0292447  hitchhiker  0.00582616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1519  sulfatase  24.63 
 
 
537 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0408631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>