More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3307 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1094  ABC transporter related protein  60.82 
 
 		 584 aa  739    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854405  normal  0.257792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  100 
 
 		 585 aa  1191    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2165  ABC transporter related  59.96 
 
 		 581 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2233  ABC transporter related  59.52 
 
 		 579 aa  679    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  31.62 
 
 		 606 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  29.98 
 
 		 577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  31.67 
 
 		 589 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.47 
 
 		 587 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  31.84 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  29.75 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  30.53 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  31.83 
 
 		 578 aa  280  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  32.45 
 
 		 592 aa  278  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  30.18 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  30.46 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  28.87 
 
 		 626 aa  277  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  27.89 
 
 		 588 aa  273  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  29.66 
 
 		 581 aa  273  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  33.91 
 
 		 641 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  30.43 
 
 		 578 aa  270  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  31.03 
 
 		 583 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.48 
 
 		 581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.84 
 
 		 608 aa  267  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  30.63 
 
 		 588 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  29.58 
 
 		 588 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  30.8 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  28.34 
 
 		 733 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  28.29 
 
 		 589 aa  264  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.4 
 
 		 555 aa  264  4e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 		 604 aa  263  4.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  29.88 
 
 		 611 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.82 
 
 		 575 aa  263  6e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  28.75 
 
 		 577 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.01 
 
 		 580 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  27.76 
 
 		 607 aa  263  6.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.15 
 
 		 581 aa  263  8e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  28.71 
 
 		 622 aa  263  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.6 
 
 		 636 aa  262  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  28.27 
 
 		 582 aa  262  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  30.49 
 
 		 583 aa  259  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  29.08 
 
 		 589 aa  259  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  28.7 
 
 		 591 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  28.06 
 
 		 590 aa  259  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  32.63 
 
 		 642 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  29.21 
 
 		 663 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  30.66 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  29.76 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  29.29 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.21 
 
 		 593 aa  257  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  30.31 
 
 		 575 aa  256  9e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  28.62 
 
 		 569 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  28.09 
 
 		 623 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.3 
 
 		 597 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.13 
 
 		 597 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  29.15 
 
 		 614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  28.57 
 
 		 592 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  29.26 
 
 		 578 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  29.29 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  27.72 
 
 		 607 aa  254  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  30.84 
 
 		 680 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  29.48 
 
 		 617 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  29.81 
 
 		 579 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  27.99 
 
 		 583 aa  252  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  24.83 
 
 		 625 aa  252  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  26.83 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  28.83 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  28.92 
 
 		 608 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  30.32 
 
 		 584 aa  250  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  28.5 
 
 		 620 aa  250  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.6 
 
 		 597 aa  250  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  29.45 
 
 		 584 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.4 
 
 		 583 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.06 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  27.54 
 
 		 631 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  28.05 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  28.55 
 
 		 585 aa  248  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  27.65 
 
 		 583 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  29.04 
 
 		 650 aa  247  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.11 
 
 		 573 aa  247  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  27.4 
 
 		 594 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  28.98 
 
 		 607 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  27.69 
 
 		 585 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  28.28 
 
 		 663 aa  246  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  28.44 
 
 		 586 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  27.68 
 
 		 582 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  27.29 
 
 		 600 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  28.16 
 
 		 579 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.82 
 
 		 677 aa  245  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.2 
 
 		 702 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  32.48 
 
 		 613 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  28.39 
 
 		 586 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7143  ABC transporter related  30.83 
 
 		 587 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.87 
 
 		 583 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  27.18 
 
 		 597 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  27 
 
 		 611 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  27.69 
 
 		 583 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  27.69 
 
 		 583 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 		 583 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  29.79 
 
 		 577 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  26.33 
 
 		 628 aa  244  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>