More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3133 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  65.83 
 
 		 795 aa  1050    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 776 aa  1590    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 812 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 860 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 789 aa  240  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 824 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 785 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 782 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 767 aa  228  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 814 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 710 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 719 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 770 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 710 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 809 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 792 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 815 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 769 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 810 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 837 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 696 aa  207  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 825 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 706 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 825 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 706 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 817 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 809 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 757 aa  204  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 707 aa  203  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 709 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 806 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 864 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 852 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 816 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 715 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 694 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 771 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.68 
 
 		 801 aa  194  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 726 aa  193  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 733 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 727 aa  193  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 819 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 701 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 828 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 786 aa  191  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 726 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 797 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 762 aa  189  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  26.11 
 
 		 696 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  26.11 
 
 		 696 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 907 aa  188  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  26.11 
 
 		 696 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.81 
 
 		 695 aa  187  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 757 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 736 aa  187  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 705 aa  187  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 755 aa  187  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 726 aa  187  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  26.11 
 
 		 696 aa  187  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 828 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 727 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  26.11 
 
 		 698 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 724 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.05 
 
 		 833 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 706 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 828 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 781 aa  184  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 850 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 791 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 703 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 701 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 723 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.6 
 
 		 703 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 791 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 700 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 689 aa  181  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 714 aa  181  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 797 aa  181  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 810 aa  181  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  29.3 
 
 		 791 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 821 aa  180  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 817 aa  180  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 799 aa  180  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.46 
 
 		 703 aa  180  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 822 aa  180  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 713 aa  180  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 766 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 734 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 806 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 733 aa  177  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 794 aa  177  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 829 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 793 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 732 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  26.28 
 
 		 726 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  27.22 
 
 		 729 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 701 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 703 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>