201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3099 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  54.5 
 
 
794 aa  911    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  52.44 
 
 
799 aa  884    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  49.61 
 
 
821 aa  816    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  100 
 
 
797 aa  1669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  43.48 
 
 
801 aa  621  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  42.53 
 
 
798 aa  618  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  41.8 
 
 
779 aa  598  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  40.11 
 
 
828 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  38.18 
 
 
777 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  41.09 
 
 
752 aa  562  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  39.05 
 
 
803 aa  558  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  38.09 
 
 
776 aa  551  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  38.52 
 
 
779 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  37.74 
 
 
768 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  35.82 
 
 
785 aa  508  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  38.92 
 
 
746 aa  502  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  37.23 
 
 
792 aa  499  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  35.38 
 
 
825 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  36.55 
 
 
779 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  35.19 
 
 
845 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  33.16 
 
 
806 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  35.59 
 
 
828 aa  459  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  33.98 
 
 
836 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  40.71 
 
 
816 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  38.94 
 
 
743 aa  403  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  35.81 
 
 
702 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  33.43 
 
 
770 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  31.23 
 
 
728 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  35.11 
 
 
715 aa  379  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  35.54 
 
 
700 aa  367  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  36.79 
 
 
815 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.71 
 
 
788 aa  356  7.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  29.7 
 
 
790 aa  349  9e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  31.53 
 
 
715 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  35.14 
 
 
661 aa  343  7e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  31.08 
 
 
715 aa  343  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  31.58 
 
 
762 aa  342  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 
799 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  29.78 
 
 
791 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 
791 aa  340  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  32.47 
 
 
787 aa  338  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  29.66 
 
 
789 aa  337  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  31.59 
 
 
795 aa  333  6e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  31.59 
 
 
795 aa  333  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.67 
 
 
791 aa  333  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  31.99 
 
 
692 aa  333  7.000000000000001e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  33.28 
 
 
911 aa  329  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  34.09 
 
 
656 aa  326  1e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  30.19 
 
 
685 aa  324  4e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.33 
 
 
788 aa  322  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  30.07 
 
 
788 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  33.16 
 
 
952 aa  314  4.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  31.59 
 
 
687 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  28.31 
 
 
803 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.71 
 
 
821 aa  304  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  28.38 
 
 
803 aa  300  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  31.38 
 
 
683 aa  299  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  28.25 
 
 
803 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  28.36 
 
 
806 aa  298  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  29.42 
 
 
821 aa  297  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  28.51 
 
 
806 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.18 
 
 
839 aa  296  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  28.18 
 
 
806 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  28.27 
 
 
836 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 
806 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 
806 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  33.14 
 
 
956 aa  295  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 
813 aa  294  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  32.18 
 
 
784 aa  290  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  28.53 
 
 
806 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  31.42 
 
 
712 aa  281  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  29.7 
 
 
760 aa  279  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  32.72 
 
 
765 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  28.02 
 
 
765 aa  272  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  30.63 
 
 
1024 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  29.21 
 
 
764 aa  266  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  27.27 
 
 
783 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  28.75 
 
 
764 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  26.79 
 
 
749 aa  253  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  27.7 
 
 
681 aa  251  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  28.2 
 
 
779 aa  246  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  28.53 
 
 
757 aa  244  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  27.79 
 
 
804 aa  242  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  27.94 
 
 
775 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
695 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  28.99 
 
 
780 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  28.88 
 
 
775 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  30.69 
 
 
840 aa  233  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  26.38 
 
 
760 aa  230  7e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  28.22 
 
 
772 aa  230  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  27.33 
 
 
777 aa  230  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  27.52 
 
 
770 aa  227  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 
799 aa  226  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  28.6 
 
 
772 aa  225  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  26.94 
 
 
794 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  26.62 
 
 
795 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  25.86 
 
 
771 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  30.58 
 
 
712 aa  223  9e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  27.09 
 
 
774 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
778 aa  221  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>