232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3088 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  100 
 
 		 60 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  90 
 
 		 60 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  86.67 
 
 		 60 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  88.33 
 
 		 60 aa  111  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  86.67 
 
 		 60 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  80.65 
 
 		 62 aa  100  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  76.67 
 
 		 60 aa  100  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  75 
 
 		 60 aa  97.1  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  77.05 
 
 		 61 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  73.77 
 
 		 61 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  66.13 
 
 		 57 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  65.62 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  60.34 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  65 
 
 		 59 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  55.38 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  65.57 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  62.3 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  53.03 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  53.03 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  59.38 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  59.38 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  53.12 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  53.12 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0095  50S ribosomal protein L33  56.6 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  58.82 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  53.33 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  51.67 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  65.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 		 49 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0975  50S ribosomal protein L33  63.33 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262128  normal  0.195912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  63.93 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14791  50S ribosomal protein L33  46.97 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1029  50S ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000770423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  53.7 
 
 		 49 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  62.3 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  47.54 
 
 		 55 aa  50.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1361  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000386724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  42.37 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2110  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  40.68 
 
 		 54 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1954  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  48.9  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 54 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 52 aa  47  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  44.26 
 
 		 56 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 52 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 52 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 52 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145a  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00313343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0076  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000689148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  50 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2734  50S ribosomal protein L33  40.98 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  39.34 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>