More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3070 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 428 aa  886    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  59.58 
 
 		 428 aa  519  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  50 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  49.88 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  47.18 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  48.36 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  47.66 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  44.52 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.77 
 
 		 424 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  35.27 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.14 
 
 		 427 aa  252  8.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  36.53 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36.51 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  36.09 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.05 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 		 435 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.5 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  34.73 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  34.3 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  34.23 
 
 		 431 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  37.06 
 
 		 434 aa  239  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  34.24 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 		 438 aa  236  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.36 
 
 		 441 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.45 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 		 431 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  34.74 
 
 		 437 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 422 aa  229  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.98 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.38 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.17 
 
 		 457 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  33.33 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  35.07 
 
 		 451 aa  226  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.13 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  35.28 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  32.72 
 
 		 817 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  31.98 
 
 		 813 aa  223  6e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  33.9 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  36.22 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.6 
 
 		 432 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  34.06 
 
 		 419 aa  220  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  34.09 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  35.64 
 
 		 422 aa  219  7e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.3 
 
 		 466 aa  219  7e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.81 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.71 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  32.81 
 
 		 878 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  36.36 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  32.2 
 
 		 416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  31.66 
 
 		 847 aa  213  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.65 
 
 		 424 aa  212  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.81 
 
 		 438 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  32.91 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  34.25 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  31.58 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  34.4 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  32.78 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  31.34 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  31.26 
 
 		 810 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  34.98 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  35.01 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 438 aa  202  7e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.72 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  30.65 
 
 		 465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.66 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  30.27 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.81 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  30.49 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  30.49 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  30.49 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  30.49 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  30.36 
 
 		 840 aa  196  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  31.7 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.27 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  31.93 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.12 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  31.28 
 
 		 426 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  29.5 
 
 		 427 aa  193  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  37.27 
 
 		 437 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  31.94 
 
 		 432 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  30.37 
 
 		 421 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.2 
 
 		 433 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.45 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  30.9 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  29.83 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  33.33 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  34.2 
 
 		 526 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  31.94 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  34.56 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.25 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  33.77 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>