More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3069 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  39.88 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 180 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.95 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  31.95 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  32.21 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  30.91 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  30.91 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 215 aa  85.5  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 179 aa  85.1  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  29.83 
 
 		 177 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.86 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  30.2 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  31.03 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  29.14 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  33.85 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>