More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3056 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 543 aa  1097    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.53 
 
 		 988 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.25 
 
 		 1022 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.77 
 
 		 1056 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.15 
 
 		 818 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.15 
 
 		 1056 aa  186  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 		 784 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.99 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 649 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 617 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.7 
 
 		 706 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.6 
 
 		 746 aa  156  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1276 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 605 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 		 392 aa  154  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.74 
 
 		 373 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  36.33 
 
 		 306 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 331 aa  146  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.99 
 
 		 738 aa  146  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  38.37 
 
 		 334 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.77 
 
 		 706 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 450 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  38.56 
 
 		 306 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  39.02 
 
 		 750 aa  138  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  34.92 
 
 		 581 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 927 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  38.05 
 
 		 539 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.86 
 
 		 810 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  35.18 
 
 		 582 aa  133  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.93 
 
 		 471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 292 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 371 aa  130  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 4079 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  27.44 
 
 		 442 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 292 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 547 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.5 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 687 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 342 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.63 
 
 		 629 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.01 
 
 		 1694 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.82 
 
 		 839 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.88 
 
 		 289 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.92 
 
 		 357 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.49 
 
 		 286 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 594 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 804 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.72 
 
 		 820 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 556 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 352 aa  117  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 615 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 		 308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.02 
 
 		 286 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 295 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 		 280 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.31 
 
 		 2240 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 421 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  30.81 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 291 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 562 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 284 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 301 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 389 aa  110  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  24.64 
 
 		 369 aa  110  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.58 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.58 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  21.04 
 
 		 1013 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 349 aa  107  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  28.62 
 
 		 338 aa  107  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  31.75 
 
 		 295 aa  107  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 260 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  39.15 
 
 		 271 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 308 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.5 
 
 		 261 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  31.75 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  31.72 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 391 aa  104  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.4 
 
 		 887 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.98 
 
 		 1737 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0428  TPR domain-containing protein  30.24 
 
 		 246 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.562836  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.57 
 
 		 573 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>