More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2918 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  74.49 
 
 		 248 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  74.27 
 
 		 270 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  66.26 
 
 		 275 aa  348  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  66.24 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  57.26 
 
 		 320 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  56.22 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  55.65 
 
 		 510 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  57.27 
 
 		 314 aa  280  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 312 aa  276  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  56.19 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  52.99 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  52.92 
 
 		 512 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  56.56 
 
 		 322 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  56.88 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  57.21 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  53.36 
 
 		 594 aa  264  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  52.36 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  53.39 
 
 		 319 aa  261  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  52.91 
 
 		 325 aa  261  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 319 aa  258  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  53.54 
 
 		 333 aa  256  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  48.19 
 
 		 590 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  50.91 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  46.77 
 
 		 590 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  47.41 
 
 		 593 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  47.58 
 
 		 581 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 578 aa  248  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  50.91 
 
 		 578 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 578 aa  248  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 578 aa  248  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  50.91 
 
 		 578 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 578 aa  248  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  50.91 
 
 		 578 aa  248  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  52.75 
 
 		 579 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 578 aa  247  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 578 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  50 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  46.89 
 
 		 582 aa  245  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  49.56 
 
 		 350 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  45.71 
 
 		 575 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  47.77 
 
 		 585 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  45.12 
 
 		 583 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 578 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 		 576 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 578 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 578 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 578 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 585 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 578 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  47.48 
 
 		 580 aa  241  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 580 aa  241  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  47.18 
 
 		 599 aa  241  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 583 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 589 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  46.09 
 
 		 582 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  47.48 
 
 		 579 aa  238  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  47.11 
 
 		 576 aa  238  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  46.89 
 
 		 580 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  46.34 
 
 		 593 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  44.72 
 
 		 578 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  47.64 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  45.92 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  46.96 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  49.36 
 
 		 911 aa  235  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  50.45 
 
 		 651 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  49.32 
 
 		 667 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  49.08 
 
 		 580 aa  235  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  49.08 
 
 		 580 aa  235  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  47.48 
 
 		 580 aa  234  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  45.56 
 
 		 599 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  45.45 
 
 		 1017 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  45.85 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 1171 aa  232  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  45.12 
 
 		 1071 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  46.05 
 
 		 335 aa  231  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  45.12 
 
 		 1071 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  45.49 
 
 		 1066 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  45.12 
 
 		 1079 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  46.55 
 
 		 1082 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 		 1089 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  47.2 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 930 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.08 
 
 		 907 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  45.73 
 
 		 920 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  50.23 
 
 		 578 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  44.17 
 
 		 921 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 		 340 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  44.77 
 
 		 929 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  48.46 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  45.85 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  43.27 
 
 		 927 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.69 
 
 		 913 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  43.03 
 
 		 906 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  44.83 
 
 		 906 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  43.82 
 
 		 918 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>