More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2841 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  100 
 
 		 468 aa  928    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  49.15 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  45.89 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  44.18 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  43.66 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  42.12 
 
 		 475 aa  353  5e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  41.96 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 475 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 448 aa  157  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 486 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 518 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.67 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  22.81 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 464 aa  140  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 454 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.99 
 
 		 496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 525 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 499 aa  133  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 461 aa  133  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 438 aa  132  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 486 aa  131  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 458 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.72 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.46 
 
 		 454 aa  127  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 470 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 498 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 467 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 467 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 486 aa  116  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 466 aa  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  25.54 
 
 		 455 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 538 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 503 aa  110  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 455 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 520 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  22.97 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 464 aa  107  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 465 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 501 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  24.43 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  24.22 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  22.27 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  21.82 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 516 aa  103  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 448 aa  103  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  21.65 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 521 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  21.96 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  24.55 
 
 		 491 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>