More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2806 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 509 aa  1060    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  62.45 
 
 		 512 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  56.34 
 
 		 497 aa  588  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  51.57 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  52.55 
 
 		 313 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  49.26 
 
 		 296 aa  289  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  46.32 
 
 		 277 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2220  WD40 domain protein beta Propeller  43.91 
 
 		 275 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661774  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2002  WD40 domain protein beta Propeller  43.93 
 
 		 276 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04330  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  37.79 
 
 		 408 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  38.83 
 
 		 215 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0570  hypothetical protein  35.25 
 
 		 314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0247  hypothetical protein  34.48 
 
 		 294 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0475  hypothetical protein  33.23 
 
 		 341 aa  143  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  36.16 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  34.94 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  35.71 
 
 		 316 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  38.98 
 
 		 429 aa  90.1  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  32.77 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.96 
 
 		 425 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  32.93 
 
 		 451 aa  89.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  32.57 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.7 
 
 		 446 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  37.29 
 
 		 443 aa  87  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  37.29 
 
 		 440 aa  86.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  29.09 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  38.18 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  36.54 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  37.27 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.68 
 
 		 1097 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.54 
 
 		 567 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  39.29 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  36.3 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.44 
 
 		 572 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  35.45 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  33.73 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.73 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  27.73 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  25.84 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  34.48 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  27.73 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  35.4 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  35.62 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  35.54 
 
 		 432 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  25.99 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  37.19 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  26.02 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  33.33 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  37.19 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  37.19 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  37.19 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  38.02 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  37.19 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  37.19 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  25.63 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  25.63 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  37.19 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  26.46 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.34 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.33 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  25.65 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  38.83 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  39.81 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  39.81 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  36.08 
 
 		 1062 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  38.68 
 
 		 615 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  24.82 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  29.28 
 
 		 1014 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  36.48 
 
 		 419 aa  76.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.33 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  25 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  26.07 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  34.58 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  29.36 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  38.83 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  34.93 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  21.77 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  25 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  25 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  38.46 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  38.83 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  29.11 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  27.24 
 
 		 717 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.34 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.4 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  30.94 
 
 		 1005 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  39 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 		 646 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  32.43 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.31 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>