296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2739 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1074 aa  2179    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  33.65 
 
 		 1125 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1100 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1129 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1105 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1097 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  32.52 
 
 		 1041 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1077 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1074 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1071 aa  350  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  28.41 
 
 		 1056 aa  342  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  27.03 
 
 		 1081 aa  323  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  26.04 
 
 		 1068 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  25.28 
 
 		 1051 aa  280  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  25.41 
 
 		 1057 aa  251  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.07 
 
 		 1066 aa  248  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  24.7 
 
 		 1061 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.18 
 
 		 1008 aa  225  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1068 aa  202  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  27.84 
 
 		 1116 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1052 aa  161  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1071 aa  155  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1067 aa  154  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1053 aa  150  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1066 aa  144  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  24 
 
 		 1125 aa  128  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 1065 aa  115  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 1149 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 1232 aa  105  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 1176 aa  104  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 1041 aa  104  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 1123 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 1105 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1069 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1075 aa  99  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1173 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1105 aa  97.8  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  22.97 
 
 		 1195 aa  97.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1075 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  30.06 
 
 		 1210 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1109 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  23.82 
 
 		 986 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1196 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1141 aa  92  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1120 aa  91.3  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1126 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 1114 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1122 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  27.62 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 1188 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1008 aa  85.5  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  24.74 
 
 		 1203 aa  84.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 1206 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 1008 aa  83.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1066 aa  83.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 1026 aa  81.6  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.46 
 
 		 1162 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1153 aa  81.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1167 aa  79.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  25.08 
 
 		 1298 aa  79.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.07 
 
 		 1037 aa  79  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 897 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1162 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1054 aa  77  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1257 aa  74.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  23.4 
 
 		 1194 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 1087 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 991 aa  72.4  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1122 aa  72.4  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 933 aa  72  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 1124 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 1090 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  23.39 
 
 		 979 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1057 aa  69.3  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 1016 aa  68.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1132 aa  68.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 791 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  20.25 
 
 		 993 aa  67.4  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 1089 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 952 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1161 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  23.79 
 
 		 1012 aa  65.1  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  23.48 
 
 		 972 aa  64.7  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 888 aa  64.7  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 1049 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 793 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1102 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 1080 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 815 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1079 aa  62  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 806 aa  61.6  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1055 aa  61.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 798 aa  61.6  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  22.77 
 
 		 818 aa  61.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.78 
 
 		 997 aa  61.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  23.65 
 
 		 994 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1120 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  26.69 
 
 		 966 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 1011 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>