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for query gene Cpin_2697 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35.26 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.87 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
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NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  31.71 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
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NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 188 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 188 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
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NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
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NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  30.43 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
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NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
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NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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