160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2670 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 484 aa  995    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  42.48 
 
 		 487 aa  364  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  31.24 
 
 		 476 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  27.42 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  30.32 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  26.59 
 
 		 459 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  27.51 
 
 		 452 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  30.22 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  28.73 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  27.81 
 
 		 440 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  26.23 
 
 		 474 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  25.15 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  25.1 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  26.96 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  26.34 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  25.4 
 
 		 450 aa  97.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 486 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  26.25 
 
 		 454 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  23.17 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  28.36 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  24.28 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  26.02 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  23.02 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.46 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  22.99 
 
 		 478 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  22.39 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  37.25 
 
 		 574 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  22.37 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  22.51 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  23.91 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  21.78 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  22.89 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  39.53 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1782  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.63 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  22.4 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  34.15 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  23.54 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  21.11 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  36.36 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  36.17 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 491 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  22.42 
 
 		 531 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 456 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  22.71 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.94 
 
 		 511 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 493 aa  53.5  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 448 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  25.84 
 
 		 519 aa  53.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 614 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 504 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  37.97 
 
 		 476 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  40.32 
 
 		 547 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  37.62 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 542 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  22.12 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  36.25 
 
 		 457 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 486 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  32.56 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 481 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  22.89 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>