65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2594 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  100 
 
 		 335 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  29.63 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  28.7 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  28.7 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  28.09 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  28.4 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  27.78 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  27.78 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  31.73 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  28.14 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  28.14 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  27.8 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  30.1 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  29.89 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  29.15 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  30.9 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  27.52 
 
 		 370 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  27.17 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  29.77 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  30.24 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  29.17 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  26.3 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  28.06 
 
 		 357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  28.67 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  26.3 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  29.63 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  28.82 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  29.15 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  25.47 
 
 		 317 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  27.15 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  25.18 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  26.21 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  21.08 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  22.3 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  22.47 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  21.25 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  21.43 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  22.91 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  20.07 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  20.07 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  22.93 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  23.26 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  20.35 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.65 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  24.06 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.59 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  23.62 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  26.14 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  21.34 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  21.89 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  21.32 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  22.93 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  22.18 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  22.27 
 
 		 424 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  21.88 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  22.62 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  22.27 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  22.27 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  22.27 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.53 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  22.27 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  23.38 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  19.85 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>