More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2585 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  100 
 
 
444 aa  923    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  31.55 
 
 
422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  34.18 
 
 
407 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  35.49 
 
 
412 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2539  histidine kinase A domain protein  33.03 
 
 
417 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0466  histidine kinase  31.08 
 
 
422 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  34.75 
 
 
432 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  34.67 
 
 
347 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6737  histidine kinase  33.96 
 
 
421 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  29.26 
 
 
426 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  28.28 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3533  two-component sensor histidine kinase  33.13 
 
 
419 aa  143  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
424 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  28.62 
 
 
424 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  26.09 
 
 
427 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 
478 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  27.63 
 
 
508 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  28.77 
 
 
438 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.03 
 
 
462 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
495 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
362 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1621  histidine kinase  30.91 
 
 
421 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
468 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 
445 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  28.72 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
517 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
454 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
532 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
532 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
422 aa  90.9  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
452 aa  90.5  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 
445 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
513 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
534 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  25.85 
 
 
468 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  29.37 
 
 
466 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  26.1 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 
448 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  29.37 
 
 
466 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.1 
 
 
370 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  28.09 
 
 
454 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
466 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  28.09 
 
 
454 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
487 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  28.09 
 
 
454 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  28.28 
 
 
466 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  28.09 
 
 
454 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.28 
 
 
466 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  27.89 
 
 
454 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  24.41 
 
 
481 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.37 
 
 
455 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
421 aa  87  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  29.31 
 
 
405 aa  86.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  25.42 
 
 
448 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  27.56 
 
 
370 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  25.79 
 
 
506 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  24.92 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  24.92 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  24.92 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  23.64 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  24.85 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  24.92 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  24.92 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
448 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.19 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
448 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  24.46 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  24.46 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  24.46 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  24.46 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1184  ATP-binding region ATPase domain protein  27.15 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  25.62 
 
 
603 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  25.82 
 
 
474 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  24.46 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  24.46 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  24.46 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  27.34 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  24.92 
 
 
603 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  25 
 
 
603 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  25.36 
 
 
508 aa  84  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
445 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  23.7 
 
 
478 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  25.22 
 
 
488 aa  83.2  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1753  histidine kinase  21.88 
 
 
578 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 
504 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
546 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  23 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>