More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2556 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2556  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 105 aa  216  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2547  transposase IS3/IS911 family protein  76.19 
 
 		 105 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0772  transposase IS3/IS911 family protein  76.19 
 
 		 105 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4216  transposase IS3/IS911 family protein  76.19 
 
 		 105 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  46.46 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  46.46 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  47.42 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  45.74 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  45.74 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  45.74 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  39.13 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  37.63 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  37.63 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  37.63 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  40.43 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  36.17 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  41.67 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  41.67 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  41.67 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  41.67 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  41.67 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  41.67 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  41.67 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  33.68 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  40.62 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  33.67 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  33.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  37.86 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0287  transposase  36.17 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  35.79 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  35.79 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  35.79 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2585  transposase IS3/IS911  39.71 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682171  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  34.74 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  34.74 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3778  integrase catalytic subunit  38.2 
 
 		 386 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  35.64 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  32.95 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1241  IS3 family transposase OrfA  36.96 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00141321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  37.25 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  36.96 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  36.96 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  36.96 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  36.96 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  36.96 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  36.96 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  36.96 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  32.65 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  32.65 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0398  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0640  IS3 family transposase OrfA  35.87 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0441  transposase IS3/IS911 family protein  27.17 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2284  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  35.35 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.64 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.64 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.64 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>