26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2490 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2490  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0101  hypothetical protein  53.22 
 
 		 313 aa  322  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3496  hypothetical protein  52.01 
 
 		 315 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1102  hypothetical protein  48.84 
 
 		 313 aa  301  9e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0722  hypothetical protein  48.17 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480992  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1224  hypothetical protein  52.82 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2080  hypothetical protein  49.16 
 
 		 313 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1804  hypothetical protein  47.46 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1470  hypothetical protein  44.74 
 
 		 318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2833  hypothetical protein  46.02 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000938747  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1866  hypothetical protein  46.96 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1972  hypothetical protein  42.19 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2529  hypothetical protein  38.96 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0547  hypothetical protein  43.05 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0564  hypothetical protein  39.27 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4098  hypothetical protein  39.13 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0561  hypothetical protein  38.28 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0491  hypothetical protein  37.58 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0532  hypothetical protein  37.86 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5413  hypothetical protein  39.38 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2601  hypothetical protein  36.75 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00160673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8237  hypothetical protein  34.88 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1972  hypothetical protein  29.49 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1603  hypothetical protein  23.79 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0178539  hitchhiker  0.0000000381472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3033  hypothetical protein  26.13 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00644621  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0048  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>