More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2463 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 		 243 aa  161  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  32.78 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 247 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  33.74 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  31.56 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  29.75 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  27.05 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  29.39 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  27.71 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  27.71 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  27.71 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.11 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  27.35 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  27.76 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.98 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.39 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.4 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.15 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.59 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  23.48 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  27.67 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2834  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.499263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2937  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2308  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  23.48 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2922  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0382  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.59 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  26.88 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.59 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  23.11 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2971  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.59 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  27.09 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  37.27 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.11 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3887  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.41 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  25.65 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.39 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  23.87 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  26.48 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.49 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  26.46 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.76 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  22.98 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.67 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.77 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  26.07 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1896  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.7 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.176277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  21.57 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  22.18 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.56 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  25.69 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  24.49 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.51 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>