151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2448 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  100 
 
 		 1141 aa  2348    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  52.98 
 
 		 644 aa  174  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  40.57 
 
 		 1187 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  29.86 
 
 		 884 aa  168  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  35.74 
 
 		 957 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  40.57 
 
 		 613 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  35.53 
 
 		 615 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.2 
 
 		 14944 aa  124  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  40 
 
 		 841 aa  124  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  41.48 
 
 		 978 aa  123  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  38.46 
 
 		 1206 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  44.53 
 
 		 1504 aa  111  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5641  hypothetical protein  24.8 
 
 		 667 aa  111  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000396754  normal  0.777644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 361 aa  111  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  40.91 
 
 		 584 aa  108  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  39.88 
 
 		 578 aa  108  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  37.14 
 
 		 1314 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  25.28 
 
 		 918 aa  99.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  30.58 
 
 		 1172 aa  95.9  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  36.49 
 
 		 2252 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  39.01 
 
 		 4465 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.85 
 
 		 904 aa  87.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  46.15 
 
 		 726 aa  87.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  34.15 
 
 		 886 aa  84.7  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.56 
 
 		 1064 aa  84  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  30.87 
 
 		 778 aa  80.9  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  34.53 
 
 		 654 aa  79  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  34.31 
 
 		 772 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  29.94 
 
 		 2215 aa  77.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0330  hypothetical protein  26.51 
 
 		 684 aa  77.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  32.09 
 
 		 483 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  53.45 
 
 		 692 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 		 831 aa  76.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  39.08 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  43.02 
 
 		 613 aa  75.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  39.05 
 
 		 1292 aa  74.3  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  36.15 
 
 		 966 aa  74.3  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  37.14 
 
 		 484 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  35.37 
 
 		 503 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2955  hypothetical protein  22.82 
 
 		 704 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279784  normal  0.44486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  34.72 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  29.88 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  33.03 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.58 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 691 aa  68.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  31.3 
 
 		 563 aa  68.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  35.17 
 
 		 412 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  27.39 
 
 		 2447 aa  67.4  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2896  hypothetical protein  23.36 
 
 		 542 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 995 aa  67.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  34.21 
 
 		 569 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.87 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.37 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2744  hypothetical protein  23.53 
 
 		 684 aa  64.3  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  31.67 
 
 		 401 aa  63.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  31.5 
 
 		 1139 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1093 aa  63.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  29.35 
 
 		 1259 aa  62.4  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.86 
 
 		 794 aa  62.4  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  36.44 
 
 		 425 aa  62  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  33.1 
 
 		 510 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  32.5 
 
 		 495 aa  60.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  28.77 
 
 		 411 aa  60.1  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  30.86 
 
 		 3802 aa  59.3  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  31.88 
 
 		 771 aa  58.9  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 974 aa  58.9  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  35.29 
 
 		 2073 aa  58.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  32.17 
 
 		 913 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.07 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  31.15 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  30 
 
 		 664 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  31.65 
 
 		 560 aa  58.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  28.43 
 
 		 2392 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  27.59 
 
 		 474 aa  58.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.66 
 
 		 943 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  25.4 
 
 		 569 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  30.47 
 
 		 914 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2899  hypothetical protein  21.44 
 
 		 550 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  37.21 
 
 		 955 aa  56.2  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  30.77 
 
 		 913 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.67 
 
 		 476 aa  55.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1024 aa  55.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  29.36 
 
 		 1236 aa  55.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  29.08 
 
 		 566 aa  55.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.25 
 
 		 618 aa  55.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  31.87 
 
 		 1441 aa  55.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.41 
 
 		 507 aa  55.1  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  27.59 
 
 		 487 aa  55.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  31.91 
 
 		 482 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  30.33 
 
 		 915 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  35.63 
 
 		 882 aa  54.3  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  30.34 
 
 		 889 aa  54.3  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  27.74 
 
 		 1413 aa  54.3  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  27.52 
 
 		 487 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  24.02 
 
 		 906 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  28.79 
 
 		 849 aa  53.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.77 
 
 		 1293 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  27.13 
 
 		 445 aa  53.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.63 
 
 		 558 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>