More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2429 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  519  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 
256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
254 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.82 
 
 
254 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.82 
 
 
255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
255 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
259 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
254 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
252 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  56.45 
 
 
256 aa  257  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.2 
 
 
250 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.85 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
256 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
253 aa  254  9e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
253 aa  251  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
254 aa  249  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
252 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
253 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
253 aa  248  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  49.6 
 
 
254 aa  247  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
253 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
253 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 
251 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.98 
 
 
259 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.7 
 
 
269 aa  245  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 
269 aa  244  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.94 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.62 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
252 aa  242  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
253 aa  240  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
251 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
251 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
256 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.95 
 
 
194 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  44.62 
 
 
252 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
247 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
256 aa  214  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
250 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
275 aa  202  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.63 
 
 
252 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  41.83 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
262 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
247 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
248 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
248 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
248 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
263 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.11 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
255 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
254 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
255 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
247 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
253 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 
252 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
252 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 
252 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
252 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.36 
 
 
247 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
248 aa  165  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 
254 aa  164  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
257 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
246 aa  161  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
254 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
254 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
253 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
253 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  37.35 
 
 
255 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
247 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
254 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
246 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 
246 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
261 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
257 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
246 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
254 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
247 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>