258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2411 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  77.88 
 
 		 632 aa  1040    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  100 
 
 		 635 aa  1326    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  72.4 
 
 		 636 aa  967    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  74.96 
 
 		 636 aa  1014    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  44.64 
 
 		 611 aa  512  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  36.12 
 
 		 651 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  36.83 
 
 		 622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  37.03 
 
 		 622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  35.3 
 
 		 619 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  31.66 
 
 		 754 aa  300  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  35.87 
 
 		 609 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  30.83 
 
 		 650 aa  277  5e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  31.09 
 
 		 650 aa  277  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  31.56 
 
 		 633 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  31.56 
 
 		 633 aa  267  4e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  29.85 
 
 		 655 aa  263  6.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  31.22 
 
 		 633 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  34.18 
 
 		 686 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  31.3 
 
 		 643 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  32.9 
 
 		 716 aa  243  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  31.25 
 
 		 1090 aa  241  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  28.89 
 
 		 748 aa  239  8e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  31.15 
 
 		 633 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  32.61 
 
 		 797 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  31.55 
 
 		 1077 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  30.8 
 
 		 464 aa  203  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  31.48 
 
 		 952 aa  203  9e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  30.35 
 
 		 466 aa  198  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.76 
 
 		 902 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  31.17 
 
 		 2245 aa  191  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  28.09 
 
 		 1048 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  27.94 
 
 		 901 aa  184  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  29.66 
 
 		 1999 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.24 
 
 		 986 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  25.84 
 
 		 934 aa  170  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  31.01 
 
 		 479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.77 
 
 		 1099 aa  164  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  29.17 
 
 		 902 aa  161  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  30.42 
 
 		 553 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  30.42 
 
 		 553 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.42 
 
 		 752 aa  153  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.67 
 
 		 486 aa  153  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  31.71 
 
 		 1097 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.75 
 
 		 629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.57 
 
 		 795 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  26.94 
 
 		 388 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  32.38 
 
 		 268 aa  137  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.25 
 
 		 1189 aa  131  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  25 
 
 		 715 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  28.51 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  29.57 
 
 		 941 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  26.34 
 
 		 606 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.25 
 
 		 1038 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1018 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  32.6 
 
 		 237 aa  117  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.53 
 
 		 585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  25.79 
 
 		 769 aa  109  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  30.14 
 
 		 315 aa  108  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25 
 
 		 759 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25 
 
 		 759 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25 
 
 		 759 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  24.8 
 
 		 759 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  23.86 
 
 		 759 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  30.57 
 
 		 283 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.06 
 
 		 759 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.91 
 
 		 1653 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  23.86 
 
 		 759 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.9 
 
 		 759 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  23.66 
 
 		 769 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  27.49 
 
 		 1651 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  27.71 
 
 		 297 aa  100  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  25.2 
 
 		 1108 aa  99  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  23.66 
 
 		 759 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.82 
 
 		 1585 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.82 
 
 		 1585 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.24 
 
 		 1111 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.07 
 
 		 1620 aa  93.6  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1118 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.29 
 
 		 1126 aa  90.9  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1172 aa  90.9  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1139 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 		 2310 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  24.49 
 
 		 1427 aa  88.6  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  24.11 
 
 		 1175 aa  87.8  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1350 aa  87.8  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.11 
 
 		 1428 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  25.22 
 
 		 1408 aa  84.3  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  23.9 
 
 		 1137 aa  84  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  25.36 
 
 		 1261 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.55 
 
 		 1082 aa  82.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  24.29 
 
 		 1427 aa  81.6  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1116 aa  81.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  24.42 
 
 		 1284 aa  79.3  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  28.03 
 
 		 1041 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.47 
 
 		 1151 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1126 aa  78.2  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  27.67 
 
 		 1153 aa  77.4  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  29.22 
 
 		 1212 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  27.21 
 
 		 1163 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  24.73 
 
 		 1270 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>