More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2372 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 376 aa  778    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  44.03 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  29.72 
 
 		 393 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  25.64 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  29.45 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 394 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.21 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.22 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  25.41 
 
 		 404 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3025  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.88 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.88 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.15 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.71 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  26.13 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  21.91 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  22.56 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  21.32 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  25.24 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.63 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0758  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  27.98 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  25.27 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  25.24 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  29.85 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  30.13 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1146  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00446094  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.58 
 
 		 376 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  24.52 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  21.91 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0457  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.217311  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  25.13 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.48 
 
 		 775 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.77 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.41 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  26.4 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.52 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5603  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2759  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0642938  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  24.37 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 820 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.28 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1760  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  23.91 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>