56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2336 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2336  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  23.81 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  22.39 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  22.85 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  23.02 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  22.48 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  21.71 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  22.48 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  21.15 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.77 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  21.51 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  20.24 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.5 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.05 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.62 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  17.83 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  20.23 
 
 		 257 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  21.29 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  26.58 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  20.96 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  19.84 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  21.71 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  20.09 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  22.07 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  20.56 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  22.44 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.99 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  21.13 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  21.57 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  20.59 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>