More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2329 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  52.55 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  48.92 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  55.45 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  39.29 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  38.41 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  38.41 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  40.28 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.1 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  39.09 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.82 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 		 155 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  40.54 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  43.24 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.82 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.84 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.08 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 145 aa  87.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.82 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  35.07 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.07 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.07 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.07 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.07 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.07 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  54.17 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  38.68 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.06 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  30.88 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  32.06 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  43.24 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  38.74 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  34.51 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.16 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  44 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.86 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  29.55 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.06 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.38 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.68 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  31.4 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  31.4 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  37.33 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.7 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.47 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  34.13 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  35.9 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.9 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.97 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  31.5 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.5 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.59 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.11 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.47 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  29.01 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.45 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>