72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2328 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  100 
 
 
137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  43.22 
 
 
136 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  36.76 
 
 
143 aa  100  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  41.03 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  46.6 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  49.06 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  40.34 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  38.97 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  36.89 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  33.05 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  33.05 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  33.05 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.06 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  33.87 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  33.87 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  34.71 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  33.88 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  27.97 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  32.77 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  33.88 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  33.06 
 
 
172 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  33.06 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  36.72 
 
 
131 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  30.89 
 
 
136 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  23.73 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  33.9 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  32.73 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  38.82 
 
 
216 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  36.8 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  35.43 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  32.09 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  36.89 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  34.65 
 
 
133 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  26.24 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0983  DoxX family protein  28.06 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382706  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  38.98 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  26.36 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  36 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  30 
 
 
378 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  30 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.84 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  28.89 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  33.07 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  33.06 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  36.22 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  31.01 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  30.58 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  32.35 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  29.13 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  31.07 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.29 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  34.19 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  28.12 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1272  DoxX family protein  32.62 
 
 
160 aa  42.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.938699  hitchhiker  0.000000103302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  28.69 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.91 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  24.44 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  31.75 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  29.08 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  30 
 
 
138 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  31.78 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.59 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  33.33 
 
 
137 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  37.5 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  29.06 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  27.5 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  30.53 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  25.42 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  29.37 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  28.28 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  33.33 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  29.55 
 
 
153 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>