More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2246 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
341 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  50.29 
 
 
337 aa  342  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  49.85 
 
 
342 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  47.16 
 
 
340 aa  323  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  48.9 
 
 
325 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  49.84 
 
 
339 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  47.46 
 
 
330 aa  315  9e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  44.12 
 
 
336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  46.04 
 
 
338 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.16 
 
 
322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  36.95 
 
 
355 aa  239  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
353 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  43.53 
 
 
337 aa  233  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 
359 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  39.21 
 
 
358 aa  222  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 
350 aa  216  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  38.85 
 
 
348 aa  209  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  33.21 
 
 
320 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  33.99 
 
 
838 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
321 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
307 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
841 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
298 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  33.33 
 
 
283 aa  133  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  35.93 
 
 
320 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
822 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
836 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
310 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
305 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
334 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
401 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
331 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
299 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
303 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
328 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
305 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
337 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
841 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
312 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
302 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
337 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
1267 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
312 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
279 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
378 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
1267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
311 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
312 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
489 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
314 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
324 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
308 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
324 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
358 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
329 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
330 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
282 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
310 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
317 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
336 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
339 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 
1340 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
325 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.03 
 
 
311 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
314 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
376 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
314 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
336 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
334 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
346 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
325 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
298 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
298 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
335 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  23.83 
 
 
342 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  27.68 
 
 
320 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
315 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
318 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>