More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2220 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  100 
 
 
286 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  40.99 
 
 
284 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  41.9 
 
 
282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  43.28 
 
 
286 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  38.73 
 
 
288 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  38.16 
 
 
281 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  40.38 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  38.87 
 
 
287 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  39.79 
 
 
293 aa  186  4e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  43.16 
 
 
285 aa  181  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.26 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  41.28 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  39.75 
 
 
359 aa  162  6e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  35.06 
 
 
296 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  37.4 
 
 
271 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  41.74 
 
 
276 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.98 
 
 
279 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  34.81 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  34.42 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  37.31 
 
 
292 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.45 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.07 
 
 
297 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  33.46 
 
 
288 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  32.51 
 
 
280 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  34.98 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.52 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  35.46 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.1 
 
 
293 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  33.88 
 
 
285 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.91 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  33.99 
 
 
278 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  35.14 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  35.21 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  35.14 
 
 
283 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  35.14 
 
 
283 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  35.14 
 
 
283 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.14 
 
 
283 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.49 
 
 
287 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  36.62 
 
 
291 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.68 
 
 
287 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  35.94 
 
 
361 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.68 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  35.52 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  35.47 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  34.35 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  36.89 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.34 
 
 
296 aa  136  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 
285 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  34.36 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.75 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  34.75 
 
 
283 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  35.96 
 
 
278 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.14 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  33.58 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  36.29 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  35.63 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  40.62 
 
 
288 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  33.68 
 
 
285 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.47 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.96 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  36.4 
 
 
311 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  35 
 
 
280 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.72 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  35.91 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  34.46 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.34 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.38 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  31.54 
 
 
297 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  32.56 
 
 
262 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  34.83 
 
 
293 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.87 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  32.43 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  33.84 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  31.68 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  29.48 
 
 
288 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.75 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  34.1 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.19 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.65 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  36.17 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 
303 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  32.71 
 
 
288 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  32.82 
 
 
302 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  33.56 
 
 
288 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  33.07 
 
 
270 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  33.85 
 
 
310 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  30.8 
 
 
285 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  36.4 
 
 
284 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.81 
 
 
285 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  34.06 
 
 
279 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  34.24 
 
 
284 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  35.11 
 
 
280 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  34.23 
 
 
289 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  33.71 
 
 
283 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  34.57 
 
 
292 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  35.27 
 
 
255 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  34.23 
 
 
280 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  34.96 
 
 
276 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  34.35 
 
 
286 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>