270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2184 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  100 
 
 		 1362 aa  2762    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  49.8 
 
 		 465 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  50.15 
 
 		 360 aa  324  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  50.15 
 
 		 360 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  50.15 
 
 		 360 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  49.85 
 
 		 360 aa  321  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  50.76 
 
 		 360 aa  313  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  50.76 
 
 		 360 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  50.46 
 
 		 360 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  50.46 
 
 		 360 aa  310  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  50.46 
 
 		 360 aa  309  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  40.26 
 
 		 680 aa  279  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  39.51 
 
 		 376 aa  246  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  34.72 
 
 		 848 aa  234  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  33.08 
 
 		 1578 aa  232  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  34.63 
 
 		 846 aa  232  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  35.09 
 
 		 846 aa  232  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  34.71 
 
 		 846 aa  215  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  45.8 
 
 		 1152 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  36.95 
 
 		 543 aa  193  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 		 551 aa  182  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 727 aa  179  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.36 
 
 		 510 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  43.46 
 
 		 1406 aa  175  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.69 
 
 		 648 aa  174  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  54.76 
 
 		 174 aa  171  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  27.94 
 
 		 492 aa  167  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  27.08 
 
 		 674 aa  166  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  27.91 
 
 		 674 aa  164  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  28.38 
 
 		 699 aa  164  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  35.33 
 
 		 468 aa  164  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  27.32 
 
 		 674 aa  164  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  27.91 
 
 		 674 aa  163  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  26.44 
 
 		 674 aa  161  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  27.75 
 
 		 674 aa  161  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  27.75 
 
 		 674 aa  161  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  27.75 
 
 		 674 aa  161  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  27.75 
 
 		 674 aa  161  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 674 aa  157  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  33.23 
 
 		 341 aa  156  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 		 674 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  32.61 
 
 		 420 aa  152  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  29.35 
 
 		 867 aa  149  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  29.65 
 
 		 729 aa  148  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  29.65 
 
 		 729 aa  148  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 484 aa  148  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  30.22 
 
 		 565 aa  148  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  32.71 
 
 		 1271 aa  148  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.86 
 
 		 869 aa  145  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 868 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  28.25 
 
 		 483 aa  145  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 868 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.86 
 
 		 868 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  31.72 
 
 		 613 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  33.83 
 
 		 467 aa  142  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  27.79 
 
 		 483 aa  142  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  28.92 
 
 		 639 aa  141  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  28.06 
 
 		 868 aa  140  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  32.32 
 
 		 563 aa  140  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  34.64 
 
 		 516 aa  140  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  31.7 
 
 		 460 aa  140  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.61 
 
 		 868 aa  139  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  29.33 
 
 		 482 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  28.39 
 
 		 598 aa  135  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  46 
 
 		 245 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 484 aa  133  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  28.45 
 
 		 803 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  30.17 
 
 		 377 aa  131  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  28.03 
 
 		 868 aa  129  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.93 
 
 		 551 aa  128  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.19 
 
 		 848 aa  127  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  32.65 
 
 		 388 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 652 aa  126  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 863 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  31.69 
 
 		 782 aa  124  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  29.68 
 
 		 652 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.62 
 
 		 372 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  31.29 
 
 		 536 aa  122  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  45.8 
 
 		 189 aa  121  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  29.86 
 
 		 792 aa  121  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  30.49 
 
 		 382 aa  121  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  30.49 
 
 		 542 aa  119  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  30.95 
 
 		 401 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  28 
 
 		 471 aa  119  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 471 aa  119  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  28.61 
 
 		 353 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  31.27 
 
 		 662 aa  118  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  29.75 
 
 		 396 aa  118  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  29.72 
 
 		 364 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  29.27 
 
 		 854 aa  117  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  30.49 
 
 		 539 aa  116  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  31.06 
 
 		 521 aa  116  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  26.36 
 
 		 703 aa  116  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.58 
 
 		 373 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  28.11 
 
 		 563 aa  116  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  30.48 
 
 		 540 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  31.01 
 
 		 782 aa  115  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  29.74 
 
 		 425 aa  115  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  41.29 
 
 		 778 aa  114  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  26.28 
 
 		 861 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>