144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2044 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  100 
 
 		 557 aa  1144    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  50.98 
 
 		 558 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  44.35 
 
 		 563 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  41.51 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  40.9 
 
 		 577 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  39.34 
 
 		 570 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  38.3 
 
 		 566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  38.58 
 
 		 570 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  36.35 
 
 		 560 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  35.93 
 
 		 532 aa  344  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  33.8 
 
 		 573 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  34.17 
 
 		 557 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  34.72 
 
 		 536 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  32.01 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  31.89 
 
 		 584 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  30.58 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  32.7 
 
 		 580 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  32 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  31.69 
 
 		 574 aa  301  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 577 aa  300  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4013  phosphotransferase domain-containing protein  33.27 
 
 		 578 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  31.97 
 
 		 580 aa  296  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  31.5 
 
 		 578 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  29.78 
 
 		 578 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  31.44 
 
 		 592 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  31.79 
 
 		 592 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  30.31 
 
 		 562 aa  290  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  29.97 
 
 		 589 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  30.7 
 
 		 578 aa  289  9e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  30.7 
 
 		 594 aa  289  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  31.75 
 
 		 576 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  31.75 
 
 		 576 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  31.79 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  30.82 
 
 		 574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  31.99 
 
 		 592 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  30.68 
 
 		 569 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  29.71 
 
 		 569 aa  277  4e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  29.45 
 
 		 570 aa  276  6e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  30.7 
 
 		 570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  30.7 
 
 		 570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  30.26 
 
 		 574 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  30.24 
 
 		 614 aa  273  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  31.4 
 
 		 572 aa  272  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  31.43 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  31.49 
 
 		 572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  30.2 
 
 		 588 aa  270  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  31.66 
 
 		 582 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  31.32 
 
 		 573 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  31.32 
 
 		 572 aa  270  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  32.28 
 
 		 580 aa  270  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  31.32 
 
 		 573 aa  270  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  31.32 
 
 		 573 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  31.32 
 
 		 572 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  29.82 
 
 		 580 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  29.55 
 
 		 642 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  31.32 
 
 		 572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  31.14 
 
 		 572 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  31.14 
 
 		 572 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  29.89 
 
 		 572 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  29.55 
 
 		 650 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  30.96 
 
 		 573 aa  264  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  31.14 
 
 		 572 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  30.65 
 
 		 584 aa  259  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  30.41 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  30.07 
 
 		 576 aa  253  7e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  30.19 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  30.02 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.57 
 
 		 740 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  28.57 
 
 		 569 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0820  phosphotransferase domain-containing protein  28.05 
 
 		 575 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  28.45 
 
 		 578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  30.18 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  28.26 
 
 		 579 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  28.55 
 
 		 576 aa  233  8.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  26.73 
 
 		 560 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  27.24 
 
 		 562 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2809  phosphotransferase domain-containing protein  44.13 
 
 		 621 aa  230  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102526  hitchhiker  0.000714673 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  27.01 
 
 		 583 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  27.88 
 
 		 586 aa  226  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1798  family X DNA polymerase IV  27.72 
 
 		 589 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  39.44 
 
 		 650 aa  220  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  27.02 
 
 		 577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  28.62 
 
 		 582 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  28.62 
 
 		 582 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3642  phosphotransferase domain-containing protein  27.1 
 
 		 592 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  25.51 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4147  PHP-like  26.54 
 
 		 591 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4219  phosphotransferase domain-containing protein  26.54 
 
 		 591 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257415  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3298  phosphotransferase domain-containing protein  26.54 
 
 		 591 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.565465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  28.6 
 
 		 586 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4117  phosphotransferase domain-containing protein  27.1 
 
 		 592 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  27.24 
 
 		 586 aa  207  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  27.07 
 
 		 588 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0442  PHP domain protein  26.21 
 
 		 605 aa  183  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.372194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  35.74 
 
 		 339 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  37.82 
 
 		 334 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  38.2 
 
 		 347 aa  171  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  36.55 
 
 		 334 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  36.55 
 
 		 334 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  38.26 
 
 		 349 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>