16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2037 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  30.09 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2755  hypothetical protein  30.54 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  29.39 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1629  hypothetical protein  31.3 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  28.49 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  28.83 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0602  hypothetical protein  25 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  24.63 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  20.73 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  25.29 
 
 		 400 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  23.36 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  23.21 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0288  hypothetical protein  25.57 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  24.12 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  24.76 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>